El cuerpo del mártir romano San Mauro fue concedido al Real Colegio del Corpus Christi de Valencia, del que es patrón, a petición de San Juan de Ribera para una capilla que le construyó en 1605, tras haber pasado por el Convento de la Sangre y la Catedral de Valencia. El 2 de Diciembre de 1620 un gran terremoto sacudió a Alcoy produciendo grave destrucción y, a la mañana siguiente, festividad de San Mauro, se le votó como especial protector contra los seísmos. Como las autoridades alcoyanas sabían de la veneración del Colegio del Corpus Christi al santo, le pidieron una reliquia y se les concedió la mitad de un dedo meñique que se depositó en la Parroquia de Santa María.
La iglesia de San Mauro y San Francisco de Alcoy es un templo reedificado a partir del año 1948, de línea clasicista, que sustituyó a la primitiva iglesia, de estilo barroco, que fue derribada durante la contienda civil armada de 1936 a 1939.
